Muzeum posiada w kolekcji 4191 muzealiów z terenu zamieszkiwanego przez Górali Zagórzańskich oraz najbliższych okolic Rabki w tym zbiory:
- sprzętów związane z tradycyjnym rzemiosłem
- narzędzia i sprzęty rolnicze
- naczynia i przedmioty używane na co dzień w gospodarstwie domowym
- meble
- zabawki jarmarczne i ludowe
- sztukę sakralną i dewocjonalia
- szaty liturgiczne
- strój ludowy
- strój obrzędowy i akcesoria kolędnicze
- malarstwo ludowe i współczesne na szkle
- rzeźbę ludową i współczesną
- ceramikę
Dodatkowo Muzeum posiada bogate zbiory archiwalne w tym fotografie i pamiątki rodzinne.
Muzeum prowadzi również bibliotekę zakładową z 6396 pozycjami w księgozbiorze głównie z dziedziny etnografii i historii.